northern_wind: (other stories)
[personal profile] northern_wind
Дружественного пиара пост.
Прекрасные люди из Падуи сделали расширение для языка R, позволяющее какой угодно анализ и графическую репрезентацию энцефалограмм, а точнее, вызванных потенциалов.
http://cran.r-project.org/web/packages/erpR/index.html

Any beta-testing is welcome, все такое.

Date: 2014-05-15 05:58 am (UTC)
From: [identity profile] hyppocampus.livejournal.com
r - это што?
и раз уж пиаришь, заясни, пожалуйста, хотя бы в двух словах, чем это лучше ээглаба и спма?

Date: 2014-05-15 08:13 pm (UTC)
From: [identity profile] northern-wind.livejournal.com
это такой очень мощный, но контринтуитивный язык программирования для математиков

автор пишет следующее:
"у нас конечная цель - статистический анализ (и приведенные в публикабельный вид его результаты), и хотелось делать по возможности от и до в приспособленной под это среде (R тут лучше матлаба)). в некотором роде это расширенный аналог erplab - eeglab'ового плагина для вызванных потенциалов. но более лучше :), быстрее и гибче."

Date: 2014-05-15 09:26 pm (UTC)
From: [identity profile] hyppocampus.livejournal.com
прикольно
а они ему красивый гуй запилили?
а почему им не нравится делать статистику в статистике или спсс? неудобно же все считать в обрабатывающем пакете, если у тебя приличный кусок психометрии и социометрии пришивается к собственно данным - заколебешься каждый раз перезадавать, в статистике оно как-то быстрее, нэ?
как в их этом erpR, например, задать дизайн четырехфакторной ановы с тремя группами, пятью электродами (пусть средняя линия, вп же), тремя условиями и какой-нибудь сопутствующей непрерывной психометрической переменной? или я отстал и это уже не модно?

я не критиканствую, я на самом деле очень хотел бы найти что-нибудь удобненькое из такого рода пакетов
и лучше, чтобы еще и event-related oscillations умело, пусть не вейвлеты, а хотя бы модифицированный erd/ers (с модулем и децибелами, а не с квадратом и процентами). Оно же считается практически как ВП, а профита больше.

Date: 2014-05-15 09:46 pm (UTC)
From: [identity profile] northern-wind.livejournal.com
Не знаю, я мало с ним работала и без гуя.
Они хотят все делать в одной программе, чтобы не гонять туда-сюда между несколькими.
Я их очень хорошо понимаю - мне тоже вечно хочется сделать один большой скрипт, который Делает Всё, и чтобы ручками ничего не было надо.

А что мешает в коде задать любые группы, дизайн, итд? Это будут только значения переменных, которые ты потом меняешь и просто перезапускаешь скрипт.

Сейчас просто пришлю к тебе Лиринку, которая соавтор, и пусть она дальше отвечает. Я по R не специалист.

Date: 2014-05-16 12:11 pm (UTC)
From: [identity profile] lirinka.livejournal.com
"Я по R" красиво, чисто визуально :)

Date: 2014-05-16 12:06 pm (UTC)
From: [identity profile] lirinka.livejournal.com
привет, я соавтор
спасибо, это не выглядит критиканством, это хорошие вопросы.

гуй не запилили, зачем плодить сущности, когда есть Rstudio
в остальном нам удобнее с кодом

в R, а не в SPSS/статистике - ровно для того, чтобы вся pipeline происходящего была перед глазами, в виде строк кода, и если нужно что-то изменить (другой тип анализа, отобрать других испытуемых, whatever), не нужно было с нуля проделывать все шаги в гуе, а напрямую менять их в коде.
психометрия вся в тех же данных, в том же коде.
"один большой скрипт, который Делает Всё", мысль была именно в этом.

дизайн четырехфакторной ановы задается в R через, например, ezanova. это несложно вроде, если в принципе с R работать. (если нет, то там с непривычки неудобно, конечно).
просто мы уже работали в нём, и делали это исходя из своего удобства, изначально. it's got its limits, естественно.

oscillations пока не делали, потому что не работали с ними, но идея интересная, заодно какое-то новое исследование запилить под это, когда и если время будет :)

April 2017

S M T W T F S
      1
2 34 5678
9101112131415
16171819202122
23242526272829
30      

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jun. 14th, 2025 12:28 am
Powered by Dreamwidth Studios